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Comprendre la structure et la dynamique du phytoplancton en réponse aux forçages naturels et anthropiques, et contribuer au développement des outils d’analyses automatisées. Vers un Système Intégré d’Observation. ArchiMer
Lefebvre, Alain.
Les écosystèmes marins sont soumis à des pressions d’origine anthropique très importantes depuis ces dernières décennies. Parmi ces pressions, les apports excessifs de nutriments vont impacter directement le phytoplancton et indirectement d’autres niveaux trophiques compromettant ainsi les biens et services écosystèmiques. On parle alors d’eutrophisation, phénomène répandu à l’échelle mondiale. La Manche orientale et la baie sud de la mer du Nord ne font pas exception. La partie française de cette zone est marquée par des proliférations massives de la Prymnésiophycée, Phaeocystis globosa, qui aboutiront au développement d’une mousse abondante et nauséabonde sur le littoral comme à des dysfonctionnements au sein des habitats benthique et pélagique. C’est...
Tipo: Text Palavras-chave: Manche; Baie sud de la mer du Nord; Eutrophisation; Habitat pélagique; Phytoplancton; Abondance; Diversité; Hydrologie; Climat; Observation; Surveillance; Écologie numérique; Modélisation; Haute fréquence; Systèmes automatisés; Stations instrumentées; Ferry Box..
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00360/47103/47027.pdf
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Compte Rendu Atelier Phyto Grand Ouest 2017 ArchiMer
Manach, Soazig; Neaud-masson, Nadine.
L’édition 2017 de l’Atelier Phyto du Grand Ouest s’est déroulé les 19 et 20 janvier au LER/MPL de la Trinité sur Mer. Pour cette quatrième édition, 14 analystes du phytoplancton marin de différents LERs (Normandie, Bretagne Nord, Bretagne Occidentale et Morbihan Pays de Loire) se sont réunis afin d’échanger sur les différents problèmes rencontrés, cette année, au cours des identifications et dénombrements du phytoplancton. La coordination REPHY et un agent de DYNECO-PELAGOS se sont joints aux réflexions. Les discussions ont porté principalement sur l’indentification des espèces et l’harmonisation des pratiques de saisies dans la base de données Quadrige².
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Taxinomie.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00388/49963/50541.pdf
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Compte-rendu atelier phyto du grand ouest 2018 ArchiMer
Legendre, Aurelie; Neaud-masson, Nadine.
Phytoplankton analysts from the North and West coastal regions of France met together for the 5th edition of the phytoplankton workshop between 12 - 13 April 2018 in Dinard. During these two days, the analysts could share the challenges they face regarding the identification of some species and about the development of nomenclature as well.
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Microalgue; Taxinomie; Identification / Phytoplankton; Microalgae; Taxonomy; Identification.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59870/63043.pdf
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Cultures et élevages de masse dans le contexte d'une écloserie-nurserie de mollusques bivalves : les productions phytoplanctoniques et le grossissement des post-larves ArchiMer
Le Borgne, Y.; Marin, J.; Vergonzanne, G..
The hatchery-nursery from the Société Atlantique de Mariculture settled in Barfleur studied within the ECOTRON program set up by C.N.E.X.O. the characteristics of mass cultures for monospecific phytoplancton and of the rearing of oyster spat (Ostrea edulis. Crassostrea giqas) and clam spat (Venerupis semi­decussata) . The maintenance features of the cultures in order to obtain cell densities around 1 million cell/ml. (or 50 g. of dry weight/m3) in containers up to 5000 liters have been established for the main species used in aquaculture (Isochrysis qalbana. Monochrysis lutheri, Tetraselmis suecica. Skeletonema costatum. Phaeodactylum tricornutum. Cyclotella nana, Chaetoceros calcitrans). The spat growth in nursery without providing any cultured food...
Tipo: Text Palavras-chave: Écloserie; Nurserie; Phytoplancton; Bivalves; Naissain; Hatchery; Nursery; Phytoplancton; Bivalves; Spat.
Ano: 1979 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00305/41658/40867.pdf
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Cultures phytoplanctoniques en continu en bassins extérieurs pour complément trophique en phase d'affinage ArchiMer
Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe; Fouche, Dominique; Razet, Daniel; Soletchnik, Patrick; Faury, Nicole; Goulletquer, Philippe.
L'affinage est une technique traditionnellement utilisée autour du bassin ostréicole de Marennes-Oléron. Son but est d' améliorer la qualité, tant gustative que de résistance des huîtres Crassostrea gigas. La grande diversité des sites, des claires et l'entière dépendance vis à vis des aléas climatiques ne permettent pas d'obtenir des résultats fiables et répétitifs. Cette phase finale de l'élevage se déroule en claires traditionnelles, renouvelées en période de vives eaux dans des proportions variables (0 à 80%). C'est le seul apport trophique exogène dont bénéficient les huîtres (Soletchnick et al., 1995). Pour complémenter et stabiliser celui-ci, des cultures de phytoplancton "fourrage" ont été réalisées en bassins extérieurs. Différents auteurs ont...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Affinage; Huître creuse; Crassostrea gigas.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00076/18763/16334.pdf
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Détection automatique par visionique des Dinophysis spp. contenus dans des échantillons d'eau de mer. Premiers résultats ArchiMer
Le Dean, Loic; Gauthier, Franck.
Nous avons réalisé cette étude dans le but de fournir aux agents d'IFREMER chargés de la surveillance des eaux littorales et en particulier de la flore phytoplanctonnique, un outil permettant d'identifier et de compter les cellules de Dinophysis de façon automatique. La visionique nous semblant être une discipline qui se prêtait à ce type de détection, nous avons réalisé une étude de faisabilité d'un système d'analyse d'il}1age appliqué à la reconnaissance et au comptage de Dinophysis. Le capteur utilisé est une caméra J.V.C Tri C.C.D transmettant trois images (rouge - verte - bleue) à un ordinateur compatible A.T.. Celui ci est équipé d'un ensemble de cartes MATROX de numérisation et traitement d'images et d'un coprossesseur arithmétique. Les applications...
Tipo: Text Palavras-chave: Dinophysis; Phytoplancton; Visionique; Reconnaissance de forme; Segmentation; Binarisationcontours.
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00136/24714/22768.pdf
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Dinophysis acuminate (dinophyceae), une espèce à géométrie variable sur les côtes françaises ArchiMer
Lassus, Patrick; Marcaillou-le Baut, Claire.
Tipo: Text Palavras-chave: Morphologie; Variabilité; Ultrastructure; Croissance; France; Dinophysis acuminata; Europe; Milieu marin; Zone côtière; Phytoplancton; Pyrrophycophyta; Algae; Thallophyta; Morphology; Variability; Ultrastructure; Growth; France; Europe; Marine environment; Coastal zone; Phytoplankton; Pyrrophycophyta; Algae; Thallophyta.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00133/24468/22484.pdf
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Directive Cadre sur l’Eau. Bassin Rhône Méditerranée Corse - Année 2018 ArchiMer
Bouchoucha, Marc; Derolez, Valerie; Munaron, Dominique; Gonzalez, Jean-louis; Cimiterra, Nicolas; Tomasino, Corinne.
En Méditerranée, des campagnes de surveillance sont mises en œuvre tous les 3 ans depuis 2006 pour répondre aux objectifs de surveillance des eaux côtières et de transition. Ce rapport présente les résultats de la cinquième campagne réalisée par l’Ifremer en 2018. Le caractère pluridisciplinaire de ces campagnes de surveillance a été maintenu pour d'une part répondre à l'ensemble des enjeux de la DCE, et, d’autre part, acquérir des données en lien avec le programme de surveillance de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM, 2008/56/CE). La campagne 2018 a permis : - la mise en œuvre par l’Ifremer de stations artificielles de moules selon la méthodologie RINBIO dans l’ensemble des masses d’eau côtières (MEC) et sur 10 masses d’eau de...
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance; Méditerranée; DCE; Chimie; Phytoplancton; Macrophytes..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73224/72436.pdf
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Directive Cadre sur l'Eau. Mise en place du contrôle de surveillance dans les masses d'eau côtières du bassin Loire-Bretagne. Bilan des actions réalisées en 2007 ArchiMer
Oger-jeanneret, Helene.
Le réseau de contrôle de surveillance (RCS) de la DCE a démarré en 2007 sur le littoral Loire Bretagne (du Mont Saint-Michel à La Rochelle). Il a été développé en partenariat entre l' lfremer et l'Agence de l'Eau Loire-Bretagne. Ce rapport fait le bilan des lieux de surveillance retenus et des paramètres analysés en 2007. Les résultats de la surveillance feront l'objet d'un rapport ultérieur
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; AELB; Ifremer; Contrôle de surveillance; Hydrologie; Phytoplancton; Macroalgues; Invertébrés benthiques.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00422/53392/54255.pdf
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Distribution et role des composes soufres reduits volatils sur la speciation metallique ArchiMer
Cozic, Amandine.
A sensitive, precise and rapid analytical method was elaborated to measure simultaneously 5 volatile reduced sulfur compounds (VRSC) ; hydrogen sulfide (H2S), carbonyl sulfide (OCS), methane thiol (MeSH), dimethyl sulfide (DMS), dimethyl disulfide (DMDS). The study of VRSC in the Bay of Quiberon highlights seasonal and interannual variations of concentrations in epibenthic zone. H2S analyzed near the sediment water interface (anoxic microzones), is more elevated in summer. The OCS distribution is consistent with a predominant photodegradation in winter and a sedimentary source in summer. The variations of MeSH, DMS and DMDS are correlated with the Dinophyceae abundance. In the Seine estuary, the absence of volatile H2S in the up estuary is explained by the...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplankton; Metal speciation; DMS; Sulfur; Phytoplancton; Spéciation métallique; DMS; Soufre.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-2687.pdf
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Dynamique du phosphore et rôle comme facteur limitant de la production planctonique dans le panache de la Gironde sur le plateau continental Sud Gascogne ArchiMer
Labry, Claire.
This study was supported by the Atlantic working site of the « Programme National d’Océanographie Côtière » (PNOC, PNEC since 1999). The objectives were (1) to check the existence and to understand the mechanisms of winter phytoplankton blooms in the bay of Biscay influenced by the Gironde waters (2) to determine the limiting nutrient of the primary production associated to these blooms and to follow the seasonal evolution of the limiting nutrient, (3) to understand the consequences of this early limitation on the structuration of algal populations in spring. Since phosphorus was supposed to be the major limiting nutrient of algal growth in the Gironde plume, the different forms of the phosphorus cycle as well as the bacterial compartment, central in this...
Tipo: Text Palavras-chave: Golfe de Gascogne; Gironde; Phytoplancton; Bactéries; Phosphates; Phosphore organique; Dissous; Phosphatases; Bay of Biscay; Gironde; Phytoplankton; Bacteria; Phosphate; Dissolved organic phosphorus; Phosphatases.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12463/9298.pdf
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Ecologie alimentaire de l'huitre Crassostrea gigas : dynamiques des compositions isotopiques naturelles ArchiMer
Malet, Nathalie.
Trophic transfers of particulate organic matter sources to the Pacific oyster Crassostrea gigas were investigated in the oyster farming bay of Marennes-Oléron for two years. Stable isotope ratios of carbon and nitrogen were used to trace the origin and fate of primary production and organic matter inputs into the bay, and to depict trophic transfers to oysters that were experimentally reared according to traditional methods. Characterizing particulate organic matter sources available for oysters utilized a combination of hydrobiological parameters and stable isotope ratios. Processes of food incorporation by oysters were described for five organs such as gills, digestive gland, mantle, muscle and gonads, and were interpreted taking into account...
Tipo: Text Palavras-chave: Microphytobenthos; Phytoplankton; Organs; Trophic discrimination; Tissue turnovers; Particulate organic matter; Marennes Oléron Bay; Pertuis Charentais; Stable isotopes; Pacific oysters; Crassostrea gigas; Microphytobenthos; Phytoplancton; Hydrologie; Organes; Enrichissement trophique; Renouvellement tissulaire; Matière organique particulaire; Bassin de Marennes Oléron; Pertuis Charentais; Isotopes stables; Crassostrea gigas; Huître creuse.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-2089.pdf
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Ecotron - Embiez 8 - Modélisation de la production d'organismes planctoniques dans les bassins ArchiMer
Nival, Paul; Malara, G..
Choosing the best conditions for the cultivation of plankton in tanks is a difficult deal, which is generally solved by means of subjective estimations. A better way of looking for these conditions is the use of a mathematical model. _ We have tried to built a model that accounts for the physical and bio­logical characteristics of the tanks. The data concerning the physiological characteristics of the different group of organisms encountered are too scarce to allow all of them to be taken into account. The system studied here is composed of nutrients, phytoplankton, herbivorous copepods and rotifers to which benthic algae have been added. With the hypothesis of 3 elements (phyto - zooplankton - nutrients) it can be showed that when an equilibrium is...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Zooplancton; Culture; Modèle mathématique; Phytoplankton; Zooplankton; Culture; Mathematical model.
Ano: 1979 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00306/41673/40882.pdf
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Effects on phytoplankton growth of dissolved substances produced by fish farming ArchiMer
Arzul, Genevieve; Clement, Alejandro; Pinier, Anne.
Fish Farming enriches the water column in dissolved organic and inorganic material. These materials excreed by the fish, elutriate from uneaten food and derive from other polluting substances. Ratios of the organic/inorganic forms of substances (for example N and P) are thus modified. Such perturbations in turn affect phytoplankton development. From in vitro analyses and tests of water taken from a turbot rearing tank, we show the changes in seawater chemical composition produced as well as the way growth was modified in three phytoplankton species: the diatom, Chaetoceros gracile, and the dinoflagellates, Gymnodinium cf. nagasakiense and Alexandrium minutum. Elutriates from the granules used for feed (0.1 to 100 mg.l(-1)) were found to be stimulating,...
Tipo: Text Palavras-chave: Antibiotique; Fécès; Aliment; Aquaculture; Régulation de croissance; Phytoplancton; Urée; Antibiotic; Faeces; Feed; Fish farming; Growth regulation; Phytoplankton; Urea.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00188/29887/28340.pdf
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Effet du CHANGEMENT GLOBAL sur la BIOLOGIE de l’huître creuse (C. gigas) dans le Bassin de Marennes-Oléron. Résultats, hypothèses et discussion ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Polsenaere, Pierre; Le Moine, Olivier.
Historiquement, les pêches de larves de l’huître creuse (C. gigas) ont lieu en six stations du BMO depuis les années 70, de début juin à la première semaine de septembre. La comparaison des captures saisonnières et hebdomadaires entre les périodes P1 (1977-1991) et P2 (2000-2015) montre un ajustement de la distribution des captures de larves à un modèle polynomiale d’ordre 4 pour P1 (R2 = 0,77), puis d’ordre 2 pour P2 (R2 = 0,86). Les modèles de distribution des captures montrent que la saison de reproduction a doublé entre les deux périodes. Elle s’étend aujourd’hui de juin à septembre. Devant l’extension de la saison de reproduction, la saison de pêche expérimentale est aujourd’hui trop réduite. Toutefois, le pic d’abondance des captures n’a pas changé...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître; C. gigas; Changement global; Réchauffement climatique; Reproduction; Larve; Mortalité; Phénologie; Ostréiculture; Bassin de Marennes Oléron; Phytoplancton; Chlorophylle a; Température.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55239/56723.pdf
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Eléments nutritifs limitant la biomasse phytoplanctonique d'une lagune tropicale de Côte d'Ivoire. Comparaison des méthodes d'estimation ArchiMer
Dufour, P.; Cremoux, Jl.; Slepoukha, M..
"In vitro" enrichment experiments on natural populations have been used to determine the nutrients controlling the potential biomass of phytoplancton in the Ebrié coastal lagoon. The limiting nutrients were generally nitrogen, phosphorus and carbon, in this order ; in three cases out of eleven, P and N act simultaneously ; in an extreme eutrophication case, N, P and C were all limiting. No effect was observed following addition of metals, vitamins or chelators. The limitations deduced from the enrichment experiments show a. good agreement with the elementary composition of the external medium ; in waters potentially limited by N alone, the dissolved inorganic nutrients have a N : P ratio lower than 25. The agreement is poorer when the sestonic N : P ratio...
Tipo: Text Palavras-chave: Lagune; Estuaire; Zone tropicale; Phytoplancton; Biomasse; Eléments limitants; Tests biologiques; Composition chimique; Coastal lagoon; Estuary tropical zone; Phytoplankton; Biomass; Limiting nutrients; Bioassay; Chemlcal composition.
Ano: 1979 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00306/41689/40898.pdf
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Essai d'aptitude par comparaison Inter-analystes pour l'évaluation des performances en identification et dénombrement du phytoplancton marin. Rapport d'évaluation compétences des analystes du phytoplancton dans le cadre du réseau d'observation et de surveillance du phytoplancton et de l'hydrologie (REPHY) mis en œuvre par l'Ifremer. Exercice 2019 ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie.
The determination of phytoplankton species and the estimation of their abundance in the context of the Phytoplankton and Hydrology Monitoring and Surveillance Network, implemented by Ifremer (REPHY), are based in 2019 on 24 analysts spread over 12 sites. Proficiency testing by inter-laboratory or inter-analyst comparison is used to evaluate the performance of laboratories or analysts on specific skills. An International Phytoplankton Inter-comparison (IPI) is organized annually by the Marine Institute Phytoplankton unit of Galway (Ireland), to evaluate marine phytoplankton identification and enumeration performance. The IPI is implementing its inter-comparison exercises through the Marine Institute Ireland in cooperation with the Intergovernmental...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Comparaison Inter-Laboratoire; CIL; Comparaison Inter-Analyste; CIA; Essai d’aptitude; Phytoplankton; Inter-Laboratory Comparison; ILC; Inter-Analyst Comparison; IAC; Aptitude Test; International Phytoplankton Inter-comparison; IPI.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00665/77674/79744.pdf
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Essai d'aptitude par comparaison Inter-analystes pour l'évaluation des performances en identification et dénombrement du phytoplancton marin. Rapport d'évaluation des analystes du phytoplancton dans le cadre du réseau d'observation et de surveillance du phytoplancton et de l'hydrologie (REPHY) mis en œuvre par l'Ifremer. Exercice 2018 ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie.
The determination of phytoplankton species and the estimation of their abundance in the context of the Phytoplankton and Hydrology Monitoring and Surveillance Network, implemented by Ifremer (REPHY), are based in 2018 on 25 analysts spread over 12 sites. Proficiency testing by inter-laboratory or inter-analyst comparison is used to evaluate the performance of laboratories or analysts on specific skills. An International Phytoplankton Inter-comparison (IPI) is organized annually by the Marine Institute Phytoplankton unit of Galway (Ireland), to evaluate marine phytoplankton identification and enumeration performance. The IPI is implementing its inter-comparison exercises through the Marine Institute Ireland in cooperation with the Intergovernmental...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Comparaison Inter-Laboratoire; CIL; Comparaison Inter-Analyste; CIA; Essai d’aptitude; Phytoplankton; Inter-Laboratory Comparison; ILC; Inter-Analyst Comparison; IAC; Aptitude Test; International Phytoplankton Inter-comparison; IPI.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00592/70415/68505.pdf
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Essai d'aptitude par comparaison Inter-analystes pour l'évaluation des performances en identification et dénombrement du phytoplancton marin. Rapport d'évaluation des compétences des analystes du phytoplancton dans le cadre du réseau d'observation et de surveillance du phytoplancton et de l'hydrologie (REPHY) mis en oeuvre par l'Ifremer ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie; Chomerat, Nicolas.
The determination of phytoplankton species and the estimation of their abundance in the context of the Phytoplankton and Hydrology Monitoring and Surveillance Network, implemented by Ifremer (REPHY), is based in 2017 on 21 analysts spread over 12 sites. Proficiency testing by inter-laboratory or inter-analyst comparison is used to evaluate the performance of laboratories or analysts on specific skills. An International Phytoplankton Inter-comparison (IPI) is organized annually by the Marine Institute Phytoplankton unit of Galway (Ireland), to evaluate marine phytoplankton identification and enumeration performance. The IPI is implementing its inter-comparison exercises through the Marine Institute Ireland in cooperation with the Intergovernmental...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Comparaison Inter-Laboratoire; CIL; Comparaison Inter-Analyste; CIA; Essai d’aptitude; Phytoplankton; Inter-Laboratory Comparison; CIL; Inter-Analyst Comparison; CIA; Aptitude Test; International Phytoplankton Inter-comparison; IPI.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00436/54797/56255.pdf
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Essai de décontamination à l'échelle professionnelle de moules rendues toxiques par le phytoplancton ArchiMer
Masson, Daniel; Ratiskol, Gilles; Burgeot, Thierry; Margat, Sylvie.
Les secteurs conchylicoles atteints par les efflorescences phytoplanctoniques toxiques sont fermés par l'Administration dès que le taux de contamination devient dangereux pour la consommation humaine. Cette fermeture peut durer plusieurs mois empêchant les conchyliculteurs de commercialiser leurs produits, ce qui a des conséquences économiques parfois graves. Il n'existe jusqu'à présent aucune possibilité technique de décontaminer ces coquillages en grande quantité et dans des délais économiquement viables. L'étude entreprise visait à mettre au point une technique permettant aux professionnels de décontaminer des coquillages rapidement (quinze jours au moins) en milieu contrôlé (bassins). L'hypothèse testée était que des coquillages placés dans un milieu...
Tipo: Text Palavras-chave: Coquillages; Décontamination; Toxicité; Phytoplancton.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00134/24499/22527.pdf
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